SGI AltixUV1000 のバックアップ(No.2)

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SGI AltixUV1000 へ行く。
- 1 (2012-06-21 (木) 23:01:33)
- 2 (2012-07-13 (金) 20:06:43)

SGI Altix UV1000 †

Hostname: altix.jaist.ac.jp

System 96nodes / 1536cpu cores
- Node Spec
  - Intel Xeon Processor E7-8837 * 2sockets
  - Memory 128GB
Compilar
- Intel C, C++, Fortran
Library
- Intel MKL, VTune, Trace Analyzer, etc...

Queue CLASS †

CLASS	CORE	MEMORY	TIME	EXECUTABLE JOB	EXECUTABLE JOB/USR	Priority
TINY	1-32core	256GB	6hours	N/A	1/usr	N/A
SINGLE	1-16core	8-128GB	7days	32jobs	8jobs/usr	150
SMALL	16-64core	128-512GB	7days	16jobs	4jobs/usr	130
MEDIUM	64-128node	512GB-1T	48hours	4jobs	2jobs/usr	90
LARGE	128-256node	1-2TB	24hours	2jobs	1job/usr	70
XLARGE	256-1504node/	2-12TB	12hours	1job	1job/usr	30
APPLI	1-8node	128GB	3weeks	16jobs	4jobs/usr	110
LONG-S	1-64node	512GB	1weeks	4jobs	1jobs/usr	110
LONG-M	64-128node	512GB-1TB	96hours	2jobs	1job/usr	90

↑

Example of Script for PBS †

↑

Hybrid CASE †

#!/bin/bash
#PBS -q QUEUE CLASS
#PBS -l ncpus=32
cd ${PBS_O_WORKDIR}
export KMP_AFFINITY=disabled
export OMP_NUM_THREADS=4
mpirun -np 32 omplace -nt ${OMP_NUM_THREADS} ./a.out

↑

MPI CASE †

#!/bin/bash
#PBS -q QUEUE CLASS
#PBS -l ncpus=32
cd ${PBS_O_WORKDIR}
mpirun -np 32 dplace -s1 ./a.out

↑

OMP CASE †

#!/bin/bash
#PBS -q QUEUE CLASS
#PBS -l ncpus=32
cd ${PBS_O_WORKDIR}
export KMP_AFFINITY=disabled
export OMP_NUM_THREADS=4
dplace -x2 ./a.out

情報社会基盤研究センターのページ
http://isc-w3.jaist.ac.jp/iscenter/index.php?id=579